Platba kartou pravděpodobně bude podléhat EET, platba převodem ne. Podobně bude podléhat EET třeba platba bitcoiny nebo některými dalšími metodami. E-shop tedy bude muset rozlišit, která metoda se použije (což např. u platebních služeb jako GoPay bude vyžadovat náležitou implementaci na straně e-shopového softwaru) a podle toho odeslat nebo neodeslat data do EET a vystavit/nevystavit účtenku.