Plátce, kterému vznikla povinnost srazit z příjmů ze závislé činnosti zálohu na daň, nebo bylo uplatněno daňové zvýhodnění či vznikl nárok na daňový bonus, podává po skončení zdaňovacího období vyúčtování zálohové daně. Dosud se vyúčtování podávalo prostřednictvím tiskopisu „Vyúčtování zálohové daně z příjmů fyzických osob a funkčních požitků“. Od roku 2011 se zavádí se pojem „Vyúčtování daně z příjmů ze závislé činnosti“. Přestože zde již není slovní spojení „funkčních požitků“, jde v podstatě o totéž.
Povinnost vyúčtování zálohové daně stanoví § 38j odst. 4 zákona o daních z příjmů. Vyúčtování se podává do 2 měsíců od uplynutí kalendářního roku. Lhůty se podle pokynu ministerstva financi nově počítají na týdny, měsíce a roky. Znamená to, že posledním dnem lhůty není 28.2. jako dosud, ale 1. 3. 2011. V případě, že bude podáno povinně nebo dobrovolně vyúčtování v elektronické podobě, prodlužuje se lhůta do 20. 3. 2011 (respektive do 21. 3, protože 20. 3. je neděle). Tato lhůta je zákonem pevně daná a nelze ji prodloužit. Čtěte více: Změny ve vyúčtování zálohové a srážkové daně za rok 2010