Datové schránky se dočkaly řady vylepšení zvyšujících ochranu citlivých dat a efektivitu provozu. Ke klíčovým změnám patří zejména automatická kontrola elektronických podpisů v přijímaných PDF přílohách datových zpráv, zneplatnění certifikátu nebo ověření platným časovým razítkem. Ostatní formáty příloh datových zpráv je nyní možné centrálně převádět do PDF. Ty mohou být navíc opatřeny textovou vrstvou a podporovat vytěžování dat.
V rámci reportingu a statistik centra pro ministerstvo spravedlnosti byl vytvořen nový systém pro sledování průběhu zpracování datových zpráv. Jeho úkolem je kontrola doby trvání jednotlivých fází zpracování, upozornění na jejich případné překročení a zveřejnění aktuálního stavu poskytování jednotlivých služeb pro resort justice. Každá organizace tím získá přehled nad stavem zpracování jí příslušejících datových zpráv.