Podle mne jde o to, aby data dostali jako XML.
Akorát e-mailem ani datovkou by to nešlo, protože nik nepochopí, že nemá posílat třeba sken.
Takže to bude jak doteď, že mají webovou aplikaci, kde jde ten formulář vyklikat (případně nahrát XML, pokud Vám ho generuje nějaký účetní software), a odeslání potvrdit buď přihlášením do datovky nebo el. podpisem.