V praxi se často setkáváme s problémem zúčtování goodwillu. Goodwill představuje dlouhodobý nehmotný majetek, který lze odpisovat po dobu 60 měsíců. Goodwill je rozdíl mezi oceněním podniku (podle obchodního zákoníku) a souhrnem individuálně přeceněných složek majetku sníženým o převzaté závazky. Goodwill se v rozvaze vykazuje v položce Dlouhodobý nehmotný majetek, a to bez ohledu na jeho výši. (Nemusí se splňovat podmínka ceny vyšší než 60 tis. Kč).
Zásadní rozdíl mezi goodwillem a oceňovacím rozdílem:
- nabyvatel podniku provede individuální přecenění jednotlivých složek majetku = rozdíl je považován za goodwill,
- nabyvatel neprovede individuální přecenění = jedná se o oceňovací rozdíl k nabytému majetku.