Výbrané prostředky díky snížení slevy na dani na poplatníka, tedy z tzv. “povodňové daně”, budou podle ministerstva financí směřovat na odstranění povodňových škod. Za tímto účelem byla ve státním rozpočtu vytvoření speciální položka ve výši 4 miliardy korun. Finanční prostředky budou v r. 2011 vypláceny prostřednictvím čtyř programů MMR, MŽP, MZe a jednoho neprogramového dotačního titulu MZe. Nejvíce peněz (2,4 miliardy Kč) bude směřovat na obnovu obecního a krajského majetku a na odstranění následků povodní na státním vodohospodářském majetku (1,3 miliardy korun).