Osobně jsem, ač v Praze kde prý kontroly nechodí, zažil z FÚ dvě kontroly na účetnictví a daň z příjmu (pravda, za 24 let). Příprava na žádnou z nich nebyla delší než cca dvě hodiny, neb se vždy kontrolovalo uzavřené účetní období, které bylo "v kupě". A každá se vešla do jednoho dne, když při žádné se nenašel faktický problém, který by měl za následek nějaké penále či jinou sankci.
Kontrolní hlášení naproti tomu vyžaduje při každém podání několik hodin práce kvalifikované účetní, tedy 4 až 12x do roka, a odpovídající technické vybavení, nehledě na naprosto asymetrická práva a povinnosti u podnikatele a úřadů a z toho pramenící permanentní stres a strach, že se o něčem nedozvím, něco neudělám včas, a dostanu flastr....
Takže za mne, z hlediska náročnosti a obtěžování, ať chodí klidně kontroly, pokud dá agent pokoj s permanentní administrativní šikanou....