Mobilní verze by měla obsahovat všechny důležité funkce včetně online dokončení objednávky. Systém by měl rovněž rozpoznat, že zákazník e-shop navštívil ze svého svého chytrého telefonu, a ihned ho přesměrovat a optimalizovanou mobilní verzi. Vzhledem k šíři nabídky chytrých telefonů by měla být mobilní verze dostupná pro více mobilních systémů.
Vývoj mobilního e-shopu vyžaduje oproti vytváření webového rozhraní odlišný přístup. Má specifické požadavky na styl ovládání na dotykovém displeji telefonu. Kvůli tomu se musí přizpůsobit vzhled, rozměry a rozmístění navigačních prvků pro co nejsnadnější ovládání jedním prstem. Klíčové je i zobrazení pouze nejdůležitějších informací a celková jednoduchost uživatelského rozhraní.